所謂「煉金術」,即通過不同組合產生「金」的技術。人工孕育「生物」的嘗試亦作為神秘研究之一,種種實驗將在不為人知的現代為舞臺展開故事。本故事的關鍵在於糾合了煉金術中最高技術的產物「人工生命體(怪物)Chemy」,作為被保管在名為「Ride Chemy Card」的卡牌之中的101個生命體,Chemy為模仿蚱蜢、SL(蒸汽火車)等世上存在的萬物所製造。
但是,本應被慎重保管著的它們卻突然從卡牌中冒出,一齊遭到釋放。偶然被卷入該事件的主人公為高中生 · 一之瀨寶太郎,被托付了假面騎士Gotchard的變身腰帶「Gotchar驅動器」,與回收散落於世間的Chemy的使命。